温州蜜柑原产日本，但温州蜜柑原木的种子，则是日本僧人智惠于500年前（即我国明朝时期）到我国浙江天台山求佛后带回日本，在长岛播种后发生偶然实生变异，即产生现在所称的温州蜜柑。
温州蜜柑在日本有200多个品系，1982年在日本已注册登记。列入日本柑桔名录的温州蜜柑就有177个品系，到1983年为止，在生产上起作用和正在起作用的品系就有100多个。成熟期有早有晚，通常把温州蜜柑各品系分为早生温州蜜柑（9~10月成熟）和普通温州蜜柑（含中熟11月成熟、中晚熟12月成熟）两大品系群。后来月肥普通温州蜜柑分为5个品系群，即在来系、池田系、伊木力系、尾张系、和平系，加上早生温州蜜柑，共6个品系群。但生产上通常把温州蜜柑分为早生温州蜜柑（9~10月成熟）、中熟温州蜜柑（11月成熟）和中晚熟温州蜜柑（12月成熟）3个品系群。
从本世纪三十年代以来，我国已从日本引进近40个温州密柑品系，自选3个。它们是：
1. 早熟温州蜜柑：宫川、龟井、松木、立间、兴津、胁山、三保、国庆1号（为湖北从龟井中选出）等品系。在这些早熟温州蜜柑品系中，兴津、立间、胁山、三保、宫本等品系各有其优劣考虑发展。
2. 中熟温州蜜柑：大长、尾张、池田、山田、米泽、南柑20号、南柑4号、长桥、向山、久熊、杉山、银山、谷川、林温州、伴野、繁田、青见、茶山、后田等品系，其中茶山、捂田两品系为浙江从山田温州蜜柑中选出。这些中熟品系中，米泽、林温州、伴野、南柑20号、南柑4号、银山等6个品系可考虑发展。
3. 晚熟温州蜜柑：石川、大岩、十万温州、青岛、今村、上田、伊木力等温州蜜柑品系，可在制罐原料基地发展。
