无公害果品生产可以选用的农药有，微生物源杀虫、杀菌剂（bt、阿维菌素、浏阳霉素等）；植物源杀虫剂（烟碱、除虫菊、茴蒿素、松脂合剂等）；昆虫生长调节剂类杀虫剂（灭幼脲、扑虱灵等）；矿物源杀虫杀菌剂（机油乳剂、柴油乳剂、波尔多液、石硫合剂等）以及低毒、低残留化学农药（马拉硫磷、辛硫磷、敌百虫、杀虫脒、克螨特、螨死净、大生m～45等）。有限制地使用中毒性农药（乐果、抗蚜威、敌敌畏、灭扫利、菊酯类等）。要严禁使用高毒、高残留的“三致”（致癌、致畸、致突变）农药，包括有机合成化学杀虫剂、杀螨剂、杀菌剂、杀线虫剂、除草剂、植物生长调节剂以及混有合成农药的生物源农药和矿物源农药等，严禁施用基因工程产品及制剂。
为了减少农药污染，除了注意选用农药品种外，还要严格控制农药的施用量，应在有效浓度范围内，尽力用低浓度进行防治，喷药次数要根据药剂的残效期和病虫害发生程度来确定。不要随意提高用药剂量、浓度和次数，应从改进施药方法和喷药质量方面来提高药剂的防治效果。另外，在采果前20天应停止喷农药，以保证果品中无残留，或虽有少量残留但不超标。
无公害果品的生产要控制化学合成肥料的施用，禁止施用城市有毒垃圾、含有有毒物质（如重金属类）的工业垃圾，以及未腐熟的人粪尿和饼肥等。在果园内禁用碳铵。对果园进行测土配方施肥，或按柑橘生产的要求因地制宜地施用柑橘专用配方肥，确保树体所需氮、磷、钾三要素的平衡。把握好施肥时机。柑橘生产最需肥时期为壮果促梢及采果后，应分别在这两个时期之前10天左右重施有机肥。有机肥营养全面，肥效保持时间长，有利于改良土壤结构；而且生产的果品耐贮藏、品质好。有机肥施用前最好经过处理，一种处理是高温腐熟减少病虫害传播；一种是通过沼气转化成沼液沼渣，肥效高，是无公害水果的首选肥料；三是工厂生产有机专用肥。
允许使用的肥料种类包括：⑴有机肥料如厩肥、堆肥、沤肥、沼气肥、饼肥、绿肥、作物秸秆等有机肥；⑵腐殖酸类肥料如泥炭等；⑶微生物肥料如根瘤菌、固氮菌、磷细菌、硅酸盐细菌、复合菌等；⑷有机复合肥；⑸无机（矿质）肥料如矿物钾肥、硫酸钾、矿物磷肥（磷矿粉）、钙镁肥、石灰石（酸性土壤使用）、粉状磷肥（碱性土壤使用）；⑹叶面肥料如微量元素肥料，植物生长辅助肥料；⑺其它有机肥料。凡是堆肥，均需经50度以上发酵5～7天，以杀灭病菌、虫卵和杂草种子，去除有害气体和有机酸，并充分腐熟后方可施用。化学肥料的使用原则上要与有机肥料、微生物肥料配合施用，可作基肥或追肥，有机氮和无机氮之比以1∶1为宜（大约掌握厩肥1000公斤加尿素20公斤的比例），采果前30天要停用化肥追肥。
